清军入关，平定燕京地区，河北地区和中原地区后，迅速挺进江淮地区占领扬州，渡过长江统一江南和岭南等中国传统领土。
随后，清军平定云贵之战，平定三藩之乱，消灭吴氏伪政权统一中国的最后一场大战爆发了。
清康熙十九年(1680)，清帝玄烨以蔡毓容为绥远将军，总统诸路绿旗兵水陆并进，自沅州（今湖南沅陵）入贵州，与大将军贝子彰泰所率满洲兵会师，攻镇远卫关，尽毁吴世璠军营垒。吴军退走，清军追击至偏桥卫，又大败之，遂克镇远。吴世璠将夏国相等以2万人屯平远西南山，分兵据守江西坡天险，并布置象阵阻击清军，清军进攻不利，两天后，清军再次进攻，吴军不支，国相弃险退走。清军进克贵阳，连下安顺、石阡、都匀、思南诸府，大败吴世璠于永宁，贵州平定。彰泰统帅诸路满、汉兵40万自贵州入云南，渡盘江，破吴军于沙子哨，进至腊茄坡，复新兴所，克普安。平南大将军赖塔亦督满、汉诸路军自广西入云南，经田州、泗城、西隆进军，连败吴军，进至距安龙30里之石门坎。吴部将何继祖拥众在石门坎凭险拒守。二十年元旦，清军乘吴军不备，猛攻石门坎，前后夹击，吴军仓促应战，腹背受敌，不支退走。清军夺其隘口，复安龙所。何继祖与詹养、王有功等以2万人守黄草坝，赖塔督诸军奋力进攻，激战数日，破吴军营垒22座，俘詹养、王有功及其部下千余人，获象、马辎重甚多，遂进军曲靖，与彰泰军在嵩明州会师，合围云南省城昆明。吴世璠、胡国柄、刘起龙、郭壮图等以万人距城30里列象阵迎战。彰泰、赖塔左右夹击，吴军拼死决斗，五却五进，象群忽反践吴军于金汁河，阵地混乱，清军乘机突击，吴军溃退。清军追击至城东归化寺，自寺西至碧鸡关连营作长围数十里。吴军尺移诸将家属于王华山，空城分门防守，从水道运输，与清军相持数月。临安“今云南建水”、永顺、姚安、大理等诸路总兵相继降清。吴世璠急令马宝、胡国柱自四川，夏国柱自广西回救云南。彰泰遣兵迎击。马宝至姚安降，胡国柱走云龙州。希福破云龙州，胡自杀。夏国相走广西，李国栋围之于面板桥，国相亦降。吴世璠割地乞师于达赖喇嘛，收余众固守。九月，赵良栋军自四川克雅州复建昌，渡金沙江至云南， 与彰泰军合攻昆明。世璠出城应战，败于桂花寺。赖塔军以巨炮轰城， 日夜不息，世璠部将余从龙降清。城中食尽援绝，世璠众内乱，欲擒世璠降清，世璠、郭壮图自杀，其将何忠出降，云贵平定。
1683年清军占领台湾，消灭明郑朝廷之后，标准着清军对明朝的战争结束了。
明朝残余全部剿灭后清军进行了十几年的休整，清康熙三十五年（1696年）清朝对蒙古的莫多之战爆发，清军在昭莫多以伏击大败卫拉特蒙古准噶尔军的关键一战，昭莫多之战是清军击败噶尔丹军的关键一战。
蒙古准噶尔部首领噶尔丹自乌兰布通之战败归后，在科布多重整旧部，又从沙俄处购买枪炮，经过几年经营，逐渐恢复元气。康熙三十四年（1695年），噶尔丹再次发兵2万攻打喀尔喀蒙古，随后沿克鲁伦河一路东犯，进抵巴颜乌兰（今蒙古国温都尔汗西）。当年11月，康熙决定再次亲征讨伐，彻底解决漠西蒙古之患。按照康熙的进军计划，清军一共兵分3路：黑龙江将军萨布素率东路军9000人，出兴安岭沿克鲁伦河西进；抚远大将军费扬古、振武将军孙思克率西路军4.6万人，分别自归化（今内蒙古呼和浩特）、宁夏等地出兵，沿翁金河北上断其退路；康熙亲率中路军3.4万人，出独石口（今河北沽源南），经克鲁伦河上游北上。一切布置停当后，激战半日，准噶尔军未能冲破战阵。噶尔丹腹背受敌，全军崩溃瓦解，其妻阿努被火枪打死。清军趁夜追杀30里，至特勒尔济口方收兵，一路斩杀3000余人，收降千余人，俘获牲畜6万余头，噶尔丹仅率数十骑逃走。于次年5月3日服毒身亡。
从此，噶尔丹势孤力穷，历时近10年的叛乱终于得以平定。喀尔喀地区重新统一于清朝。噶尔丹在漠北以逸待劳，形势原为有利；清军劳师远袭，形势原本不利，但交战结果，清军却大获全胜。这一胜一负，双方在作战方面均有其深刻的经验教训。
征服蒙古势力，控制漠北和西域后，清朝征服西藏的战争打响，清安定西藏之战是康熙五十六年（1717年）至五十九年（1720年），清军击败占扰西藏的准噶尔部，征服西藏的重要战争。
康熙二十一年，西藏五世达赖喇嘛罗桑嘉措逝世，第巴桑结嘉措秘不发丧，窃据重权。十五年后，即康熙三十六清廷才发现这一阴谋。同年十月，册封六世达赖喇嘛仓央嘉措，仍由桑结嘉措任第巴，管理政务。统治西藏的另一政治势力代表为准噶尔和硕特汗。
康熙四十年，和硕特拉藏汗继位。为争夺西藏大权，拉藏汗与桑结嘉措的矛盾日益激化，终于引发出一场军事冲突。康熙四十四年七月，桑结嘉措兵败被杀，拉藏汗控制了西藏。拉藏汗经清廷批准，选立益西嘉措为六世达赖喇嘛。然而，青海各蒙古台吉另选立里塘（今四川理塘）的噶桑嘉措为六世达赖。于是，双方发生真假达赖之争，实际上反映出各派政治力量的激烈斗争。
康熙四十八年，康熙帝派户部侍郎赫寿到西藏，协同拉藏汗处理西藏政务，此为设置驻藏大臣之始。四十九年，清廷正式册封拉藏汗选立的益西嘉措为六世达赖喇嘛。五十五年，年又将青海众台吉选立的噶桑嘉措安置在塔尔寺（今青海湟中）。历经多年的真假达赖之争，表面上告一段落，实际上激流暗涌。准噶尔部首领策妄阿拉布坦乘噶尔丹与清军作战时，迅速发展力量，又因从征噶尔丹有功，被清廷信任，清廷将噶尔丹的部众全部交给他，并准其在阿尔泰山以西地区游牧。准噶尔遂发展为西域大部落。准噶尔部与和硕特部素有矛盾，策妄阿拉布坦对和硕特部拉藏汗控制西藏早就心怀不满，见拉藏汗与青海诸台吉为真假达赖争论不已，便决意趁机出兵。策妄阿拉布坦先娶拉藏汗之姐为妻，又赘拉藏汗之子为婿，使拉藏汗放松对他的戒备。
康熙五十四年，策妄阿拉布坦犯掠哈密，企图打通由新疆东部经青海入藏的道路。康熙帝立即命将军富宁安带兵前往拦截；征喀尔喀蒙古兵集结在归化城（今内蒙古呼和浩特），准备出击；命右卫将军费扬固总理军务。当年八月，富宁安率军到达巴里坤。策妄阿拉布坦将哈密等地劫掠一空而去。应富宁安建议，清军在哈密、巴里坤等地募兵屯田，以备边警。清廷另命青海诸台吉选调兵马，屯于噶斯湖畔（今青海油砂山西南），阻断由青海入藏之路。策妄阿拉布坦见清军于东面加强防御，便决定由西面入藏，即由伊犁（今新疆伊宁）经阿克苏、喀什噶尔、叶尔羌（今新疆莎车）、和阗（今新疆和田）等地，绕沙漠，翻雪山，进入西藏。
康熙五十五年十月，策妄阿拉布坦以护送拉藏汗之子噶尔丹丹衷夫妇回藏省亲为名，派大策零敦多布等率6000兵，向西藏进发。他们昼伏夜行，于次年七月到达西藏北部的纳克产（今西藏奇林错东南，加林错东北）地区，顺利通过腾格里海天险，直趋达木（今西藏当雄）。防守达木的藏军与准噶尔兵发生激烈战斗。拉藏汗正欲亲自往达木迎接亲人，却得知达木已成为战场，便仓猝调集军队，在达木一带阻击敌人。双方于达木相持两个月后，藏兵抵挡不住，于十月八日退至拉萨。
十月三十日深夜，大策零敦多布围攻拉萨，第二天，攻入城内，杀死拉藏汗，拘押达赖喇嘛，抢掠各庙宇，将贵重物品运回伊犁。策妄阿拉布坦授意大策零敦多布，在西藏组成以达克咱（即达改哇·拉嘉热丹）为第巴的亲准噶尔政权。
在策妄阿拉布坦派兵进藏之初，康熙帝判断其很有可能与拉藏汗联兵，进攻青海，因而着力加强青海的防御。康熙五十六年七月，康熙帝调署理西安将军湖广总督额伦特，由新疆巴里坤至青海西宁，料理军务粮饷；命西宁总兵官王以谦、侍读学士查礼浑在松潘预备，调荆州2000满洲兵往四川成都，太原500满洲兵往西安。九月初，康熙帝遣侍卫色楞赴青海。十月下旬，准噶尔兵正月进攻拉萨的消息，由青海亲王罗卜藏丹津奏报给朝廷，康熙帝急派都统和礼往云南；护军统领温普往打箭炉（今四川康定），防准噶尔东进川滇；命青海各台吉加强防御，并派内大臣策旺诺尔布、将军额伦特、侍卫阿齐图等，扎于青海各要地，防范准噶尔。
康熙五十七年初，康熙帝接到拉藏汗于拉萨城即将被攻破时写的奏疏。不久，又得到确切消息，拉藏汗已被杀害，西藏陷入准噶尔之手。二月十三日，康熙帝命侍卫色楞领兵2400人，由青海进讨西藏。五月十三日，色楞率兵前进到青藏交界之穆鲁乌苏（今青海通天河），将军额伦特遣人送信言，已奉旨诱准噶尔兵。对这个诱敌深入、以逸待劳的作战方案，色楞未肯接受。他求胜心切，骄傲轻敌，率兵径入西藏。额伦特奉命率兵策应，于六月十八日也越过穆鲁乌苏，由七岔河抄小路追赶色楞所部。
入藏后，色楞部接连小胜准噶尔，于是步步深入藏地，于七月二十日到达喀喇乌苏（今西藏那曲），在河北岸安营，暂待额伦特所部。约于八月初，两军会合。色楞与额伦特遂决计渡过喀喇乌苏河后，占领狼腊岭，然后挺进达木。其时，大策零敦多布已在喀喇乌苏布阵，聚集准噶尔兵和藏兵共数万人，一半防守河南岸，一半绕至清军侧后，截断了清军的饷道。清军被包围后，多次突围未成，到九月中下旬，弹尽粮绝，全军覆没。额伦特阵亡，色楞等5人被俘遇难。此战后，准噶尔更加嚣张，东进到喀木地．区，窥伺巴塘、里塘，谋犯川滇。康熙帝认为，西藏屏蔽青、滇、川，如让准噶尔长期占据，将边无宁日，遂不顾大臣们反对，决意再次出兵安藏。此次作战，进行了充分的准备。一是任命皇十四子固山贝子允禵为抚远大将军；二是派熟悉边情的四川巡抚年羹尧为四川总督，开辟由四川进藏的路线，筹足粮饷，开设驿站；三是册封塔尔寺的噶桑嘉措为新的六世达赖喇嘛，以更广泛地团结广大藏军和青海各部；四是以护送达赖喇嘛为名，进兵西藏。
康熙五十九年正月三十日，康熙帝命抚远大将军允禵率军，由西宁移驻穆鲁乌苏，居中调度；授都统延信为平逆将军，出青海，向喀喇乌苏进兵，此为清军中路；授护军统领噶尔弼为定西将军，会合云南都统武格所部，由四川巴塘进藏，此为清军南路；命靖逆将军富宁安与振武将军傅尔丹，分别于巴里坤、阿尔泰策应。当年四月，清军出发。平逆将军延信统领中路清军，护送达赖喇嘛，由西宁进藏。这条道路多深山穷谷，瘴气弥漫，清军除战胜恶劣的自然条件外，接连打破大策零敦多布的重重阻截。
八月十五日夜，大策零敦多布袭击驻于卜克河的清营，反被击败。八月二十日、二十二日凌晨，大策零敦多布先后袭击齐伦郭尔和绰马喇的清营，均被击败。大策零敦多布慌忙掉头退向拉萨，后率少数人回到伊犁。延信将大军留驻达木，率少量骑兵，护送达赖喇嘛向拉萨进发。南路清军在噶尔弼率领下，自成都启程，经打箭炉、里塘、巴塘，于六月间至察木多（今西藏昌都）；七月底八月初进至拉里（今西藏嘉黎）。时大策零敦多布派吹木丕勒寨桑，率2600人，守御墨竹工卡。噶尔弼改变原定等候中路大军的计划，于八月初六日直扑墨竹工卡。吹木丕勒寨桑逃往达木，墨竹工卡的呼图克图归顺清军。清军顺利占领墨竹工卡后，即向噶尔招穆伦渡口。这里有第巴达克咱领藏兵2000余人据守。清军一到，藏兵便不战而溃，达克咱投降。
至此，进入拉萨之路被打开。噶尔弼决定乘拉萨兵力空虚，直捣拉萨，遂命达克咱准备皮船，于八月二十二日率清军渡过噶尔招穆伦河；随即，兵分三路，进攻拉萨。二十三日晨，拉萨一攻即下。九月十五日，噶桑嘉措在布达拉宫举行六世达赖喇嘛坐床典礼。驱准噶尔安定西藏战争结束。清朝进一步加强对西藏的统治，派兵驻藏，组成四噶布伦联合掌政的西藏地方政府。
清缅战争，是1762年冬缅甸入侵中国云南普洱地区，清军自卫反击为开端，围绕中缅边境地区的领土控制权发生的一场战争。
清缅战争从边境土司小冲突开始，演变为精锐主力对决，1769年11月以缅甸称臣纳贡收场。战役中，清军统帅明瑞率领1万清军大破缅军攻到缅甸首都阿瓦附近，但在缅军大规模的坚壁清野下，清军粮尽退走，遭到缅军5万主力包围。清军趁夜色沿小路撤退，为保大军顺利撤退，统帅明瑞、扎拉丰阿、观音保让大军先走，率数百八旗兵拼死殿后皆殉国，清军万余官兵及伤病员和体弱文官都得顺利撤退。缅军惧怕明瑞，不知明瑞殉国，多次乞降，乾隆不许。最终战役，清军前线出动1.8万士兵。缅军出动主力三万余士兵，还有数百法国兵。依然是缅甸兵力占优，但双方野战能力有一定差距，整个战役，还是清军保持攻势，而缅军保持守势。
此役清军虽取得了缅甸的臣服，收复了万历年间被缅甸掠夺的孟养、木邦、蛮暮（蛮莫）等土司，但清军损失惨重，总兵吴士胜、副将军阿里衮、水师提督叶相德先后病死，傅恒亦染病卧床。此战造成东南亚一大变局，缅甸中南半岛霸主地位被大幅削弱，暹罗因此而复国；缅甸也重新认识到中国的力量，由此建立了绵延二百多年的睦邻关系。
乾隆初，大金川土司莎罗奔夺取小金川泽旺印信，又攻明正土司（今康定）。乾隆十二年（1747年），乾隆帝派张广泗和庆复进讨，后派遣讷亲到四川督师，但清军久而无功，川陕总督张广泗被清廷处死，乾隆帝改派岳钟琪为总兵，讨伐金川。乾隆十四年（1749年），莎罗奔请降，大金川事件初告平息。
以后，大小金川之间常有冲突。到18世纪60年代，金川局势再度紧张。乾隆三十一年（1766年），清廷派四川总督阿尔泰联合九家土司会攻大金川，小金川土司僧格桑（泽旺子）却与大金川土司索诺木（莎罗奔侄孙）联合反清。乾隆三十六年（1771年）清军败绩，清廷又将阿尔泰革职，派温福入川督师，向金川进兵，第二次金川之役由此开始。乾隆三十八年（1773年），温福战死，清廷又派阿桂为将军，增兵金川。经多次血战，清军于乾隆四十一年（1776年）初取胜。历时五年、死伤逾万人、耗银7000万两的第二次金川之役至此结束。
战后，清朝在大小金川分置阿尔古、美诺两直隶厅。与乾隆其他八大武功相比，偏居川西一隅、仅有弹丸之地、数万人口的大小金川，却致清王朝先后共投入了近60万人力、7000万帑币，其代价远远超过乾隆的其他任何一次武功。
1644年清军入关后，一直进行统一中国稳定边疆的战争，1776年大小金川战役结束，标志着这场经历132年的战争正式结算。由此可见，清朝非常崇尚武力，满清人比蒙古人更有战斗力，满清人比蒙古人更会统治汉人和中国，满清是金人的后裔，金朝（1115年至1234年）曾经统治中国北方地区119年，满清人应该获得金人的文化传承，因此清朝也被成为后金。
清朝统一战争结束的前一年，正好是美国建国、独立战争打响。1775年4月的莱克星顿的枪声，1776年7月4日大陆会议通过了由托马斯·杰斐逊执笔起草的《独立宣言》，宣告了美国的诞生。1783年，英国承认美国独立。自此，战争结束。
也就是说，清朝和美国走向全面和平治国只相隔几年，但是在之后的历史发展中，清朝与美国的差距就不是几年的差距，而天壤之别的巨大差距，这种巨大差距由东西方社会价值系统的不同导致。